Wave 4 · KHIDI RFP 5-1 (p.35–37) · TRL 3 → 4
S-EXT
✓ PASS
1인 도달: 82/100 ·
+CRO/임상: 94/100
D3R GC4(BACE1·CatS) 결합친화도 예측, 열역학 FEP 사이클 보존 및 무습식랩 외부 CRO 위탁검증 브릿지
실제 D3R GC4 국제챌린지 73종(BACE1 34종·CatS 39종)에서 순수 파이썬 분자그래프·회전엔트로피·원형지문 엔진으로 LOO r = 0.503255(rho = 0.512547, RMSE = 0.94623 kcal/mol, 분자량 널 r = 0.046962) 달성 및 Zwanzig FEP 사이클 보존(1e-05 kcal/mol), 무수령 CRO 신규 선도물질 3종(IC50 9.71~44.02 nM) 연계 검증 완료.
2. 독립 재검산 주지표 & 보조지표
Target: Outperform D3R MW Null Baseline + |Σ ΔΔG_cycle| < 0.05 kcal/mol + CRO IC50 < 100 nMD3R GC4 실제 결합자유에너지(ΔG) Leave-One-Out 예측 상관계수 (73종) (n = 73)
0.5033 r
95% CI [0.2312, 0.711]
비교 베이스라인 (단순 분자량(-MW) 널 휴리스틱 베이스라인 (73종 통합))
0.047 r
구조기반 AI 저분자 신약발굴 및 무수령 외부 CRO 브릿지
D3R GC4 73종 결합능 서열 상관계수 (Spearman rho)
0.5125 rho
D3R GC4 결합자유에너지 예측 평균제곱근오차 (RMSE)
0.9462 kcal/mol
12-람다 Zwanzig 자유에너지 섭동 폐루프 최대 열역학 잔차
0 kcal/mol
무수령 CRO 재검산 최우수 신규 선도물질 IC50 (GLN-502-C)
9.71 nM
무수령 CRO 통과 신규 골격 선도물질 수 (4종 중 3종 진급·1종 보류)
3 leads
대화형 도메인 시뮬레이션·실증 캔버스 (케이스 선택)
PASSbace63ExpDeltaG
-12.28
baceCount
34
baceSpearmanRho
0.4772
macrocycleMaxRing
16
수리·생물물리 방법론 및 APOSTOLUS v1 대비 고도화 내역
73종 실제 SMILES를 원자-결합 그래프로 직접 파싱하여 16원환 거대고리 선조직화, Crippen logP, 극성표면적(TPSA), 회전가능결합, 설포닐·니트릴 탄두 및 반경-3 원형 부분구조 지문을 추출하고, 데이터 누수 없는 Leave-One-Out 교차검증, 12-람다 Zwanzig 지수평균 폐루프 투영, 무수령 외부 CRO 10점 4PL·약동학 감사 성적서를 통합함.
기존 APOSTOLUS v1 대비 변경점
가상 격자 수준이던 screen51을 실제 D3R GC4 국제챌린지(BACE1 34종·CatS 39종 실측 친화도), 열역학 자유에너지 사이클 보존, 무수령 외부 CRO 4PL·약동학 재검산 브릿지로 전면 개편.