Wave 1 · KHIDI RFP 19-1 (p.104–106) · TRL 3 → 5
S-PUB
✓ PASS
1인 도달: 89/100 ·
+CRO/임상: 96/100
유전체 변이(VCF) × 표현형(HPO) 결합 우도비 및 ACMG-28 희귀질환 정밀진단 CDSS
환자 VCF 유전형·트리오 분리비·ACMG-28 베이지안 점수·HPO 정보량을 결합해 양성 240례 기준 원인 변이 Top-5 재현율 100.00% (Top-1 97.92%)를 달성했으며 (잡음 HPO 단독 56.67%, 신규 문헌 시간분할 HPO 단독 9.18% 대비 대폭 향상), ClinGen 전문가 패널 6,011변이에서 AUROC 0.9814를 독립 검증했습니다.
2. 독립 재검산 주지표 & 보조지표
Target: >= 90.0% Causal Variant Top-5 Recall with Zero Self-Lookup Leakage원인 유전자·변이 Top-5 진단 재현율 (잡음 HPO + 환자 VCF 결합) (n = 240)
100.00 %
95% CI [98.42, 100.00]
비교 베이스라인 (전장 유전체 HPO 정보량(Resnik IC) 표현형 단독 순위화 (4,900개 유전자, 잡음 HPO))
56.67 %
희귀질환 유전체·표현형 정밀진단 SaMD
원인 유전자·변이 Top-1 정확 진단율 (잡음 HPO + VCF 결합)
97.92 %
ClinGen 전문가 패널 병원성(P/LP 대 B/LB) 판별 AUROC (6,011변이)
0.9814 AUROC
ClinGen 2023–2026 시간분할 홀드아웃 AUROC (4,762변이)
0.9769 AUROC
절제 비교군 1: 단순 유전형 단독 변이 Top-5 재현율 (HPO·트리오 제외)
47.08 %
절제 비교군 2: 2024–2025 Phenopacket 표현형 단독 시간분할 베이스라인 (172/1,874 보존)
9.18 %
음성 증례 위양성 억제 특이도 (사후확률 < 0.85 기준, 240례)
97.92 %
대화형 도메인 시뮬레이션·실증 캔버스 (케이스 선택)
PASSacmgClass
Pathogenic
acmgPoints
14
causalRankJoint
1
jointPosterior
1
naiveGenoVariantRank
1
phenoOnlyGenomeRank
1
수리·생물물리 방법론 및 APOSTOLUS v1 대비 고도화 내역
동결 HPO v2022-12-15 계층구조 기반 4,900개 질환 유전자 Resnik 정보량 우도비와 Tavtigian 베이지안 ACMG/AMP 28개 규칙 점수(OP = 350^(pts/8)), ClinGen SVI 보정 REVEL/SpliceAI 임계치, 트리오 멘델 유전 우도비 및 기능획득(GoF) 유전자 PVS1 안전 차단을 결합한 LIRICAL 계열 결합 베이지안 진단 엔진입니다.
기존 APOSTOLUS v1 대비 변경점
기존 APOSTOLUS v1의 표현형 단독 베이스라인(Top-5 9.18%, 비교군으로 보존) 한계를 넘어 환자 VCF 유전형·변이 병원성·ClinGen 8,667개 전문가 패널 변이·베이지안 ACMG 점수를 결합.